أكاديمية فطرة هي مجتمع تعليمي بحثي يعني بقضايا الفطرة وما يتصل بها من موضوعات علمية وتربوية. تعمل الأكاديمية في مجالات الفطرة الثلاث: (فطرة الدين – فطرة الخلقة – فطرة الأخلاق) وذلك في مستويات التأسيس والتدريس والبحث المتقدم.
ترفع الأكاديمية شعار: غرس إيماني – بناء معرفي – نتاج عملي